En la previa del partido por Copa Argentina contra Central Córdoba, Boca Juniors vivió una práctica explosiva porque Agustín Almendra se peleó con dos compañeros y luego, con Sebastián Battaglia, el entrenador del primer equipo.
Aquella tarde, Almendra se fue de la práctica y supo que no iba a jugar más en Boca Juniors. Luego de la práctica, Battaglia tuvo una reunión con el Consejo de Fútbol y pidió que Almendra sea marginado del primer equipo. Los capitanes de Boca Juniors también pidieron la exclusión del futbolista y respaldaron al entrenador.
Desde entonces, Almendra, que llegó a tener una oferta de 20 millones de euros del Napoli (2018), fue marginado y entrena con el equipo juvenil, pero ahora podría irse definitivamente de Boca Juniors. De acuerdo a la información de Fabrizio Romano, Santos hizo una oferta formal por Almendra: préstamo por una temporada y con opción de compra de tres millones de dólares por el 50 por ciento del pase.
A lo largo de estos días, Boca Juniors recibió varios sondeos por Almendra pero el único que hizo una oferta formal por él fue Santos, que jugará la Conmebol Sudamericana y buscará pelear el Brasileirao y la Copa Brasil.